正常尿液的顏色可因飲水、出汗及活動量不同而深淺變化不等，一般從淡黃色至深琥珀色。當人體代謝異常或患某種疾患時，尿液的顏色會出現特殊改變。如在小便時發現尿液出現明顯異常顏色，這可能表示泌尿系統有問題發生，可參考下面的提示。
深黃色尿 出汗或吐瀉太過、過多進食某些食物或藥物（如胡蘿蔔、B 族維生素、核黃素、痢特靈、利福平等），可出現尿液變黃的情況，一旦停止服用，隨即消失。若小便黃得像濃茶，則要注意黃疸的可能，建議及時到醫院就診。
紅色尿 用肉眼就能看到尿呈紅色稱為肉眼血尿，尿內含有大量的紅血球。如尿液外觀無大改變，只有在顯微鏡下才可見的血尿稱為鏡下血尿。引起血尿的原因很多，常見於泌尿生殖系統炎症、結石及腫瘤等，如各型腎炎、腎結核、急性膀胱炎、尿道炎及腎結石等。全身性疾病如白血病、猩紅熱、充血性心力衰竭等也常引起血尿。女性患者在月經期留尿驗，易將陰道內經血混入尿液內，造成假性「血尿」，故月經期間留尿化驗是不可取的。此外有些藥物也可以引起紅色尿，如氨基比林、苯妥英鈉、利福平、酚紅等。
白色尿或混濁樣尿 某些特殊蔬菜和食物含有較多磷酸鹽或碳酸鹽時，特別在寒冷天氣中，尿液可呈現白色混濁或有沉澱現象出現，經過加熱和加酸後渾濁及沉澱消失則無大問題。但膿尿和菌尿時因尿內含有大量膿細胞或細菌等炎性滲出物，新鮮尿液即成渾濁樣或白色雲霧樣，加熱加酸其渾濁均不消失，此類尿多見於泌尿道化膿感染、腎盂腎炎、膀胱炎等。
乳白色尿 又稱乳糜尿，尿液如同牛奶一樣呈乳白色。這是由於腸道不能吸收糜液，造成乳糜返流進入尿中所致。引起乳糜尿有先天性因素，如先天淋巴管瓣膜功能異常；也有繼發性因素，如常見的絲蟲病及泌尿系統化膿性感染。
藍綠色尿液 多見於服用美藍、消炎痛、氨苯喋啶等藥物後。
