革命軍本部是被黑鬍子團搗毀的。具體原因請看下面。
事情要從德雷斯羅薩說起，黑鬍子一號船船長巴基斯參加了斗獸場的燒燒果實爭奪，巴基斯如願挺進決賽。
這一次對決中有薩博假扮的露西、巴基斯、巴托洛米奧、蕾貝卡和迪亞曼蒂，隨後薩博與巴基斯對上，巴基斯與薩博対招的時候，手臂上的波動裝置被薩博的龍爪勾直接捏碎。又被薩博的「火炎龍王」擊飛。於是巴基斯用言語刺激薩博，說到了艾斯的事情。薩博忍無可忍直接用剛得到的燒燒果實能力，用火拳將巴基斯徹底打敗，巴基斯因此重傷。
然而巴基斯賊心不死，就算重傷一樣偷偷潛入了革命軍的船隻中，就這樣跟隨革命軍的船來到了革命軍的本部。到了革命軍的本部巴基斯就聯繫了黑鬍子，黑鬍子隨後帶領人馬搗毀了革命軍的本部。
我是覺得事情沒那麼簡單，革命軍好歹是最讓世界政府頭疼的勢力，而且路飛的老爸龍就在那裡，這裡很有可能是革命軍的策略性轉移，黑鬍子團來的時候，其實這裡並沒有多少人在，革命軍的主力們都轉移到其他地方去了，畢竟新聞報道並沒有說到革命軍的傷亡。
龍的頭腦肯定想的更遠，現在不是和黑鬍子開戰的時候，他們的目標是推翻被鎮壓剝削的國家，現在沒必要浪費力氣和四皇黑鬍子抗衡。
既然沒有主力在，陣地搗毀其實也沒事，革命軍有多個根據地，轉移到其他地方就可以。
這就是革命軍本部變成廢墟的事情緣由。
