行政院長賴清德5月2日表示，政府不敢傷害大學自主，但社會也不會接受任何人以大學自主當作護身符，躲在後面迴避個人的責任。對此，國民黨籍台南市議員王家貞服務處臉書專頁、鳳凰花護民主市政監督聯盟臉書頁表示，民進黨才是躲在中華民國護身符後面搞台獨。
對於管中閔當選台大校長一事，教育部於4月27日宣布駁回管中閔當選台大校長。行政院長賴清德5月2日表示說，台灣經過這麼多年許多人犧牲奉獻才有民主的制度，所以台灣社會不會允許政府、政府也不敢傷害大學的自主；但同時社會也不會接受任何一個人，以大學自主作為護身符，躲在後面迴避個人的責任。
台南市國民黨籍議員王家貞服務處臉書頁、鳳凰花護民主市政監督聯盟臉書頁痛批，民進黨才是躲在中華民國護身符後面搞台獨、搞獨裁、搞鬥爭。另外，教育部3日面對立委質詢時表示「管中閔個案非行政處分」因此台大及管中閔不得提「行政救濟」，在網路上罵聲一片，不過有專業的網友指出「既然不是行政處分，那台大其實沒必要理你的決定耶」、「厲害了，超越行政法！」
